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Text File  |  1995-03-04  |  1.0 KB  |  23 lines
  1. ******************************************
  2. * Synaptophysin / synaptoporin signature *
  3. ******************************************
  4.  
  5. Synaptophysin and synaptoporin [1] are structurally related proteins, found in
  6. the membrane of  synaptic vesicles,  which  may function  as ionic  or  solute
  7. channels.  These two glycoproteins  seem to span the membrane four times. Both
  8. their N- and C-termini sequences seem to be cytoplasmically located.
  9.  
  10. As a signature pattern for  this  family  of  proteins  we  selected  a highly
  11. conserved region located  in the beginning of  the  first  intravesicular loop
  12. just after  the  first transmembrane domain.  This  region contains a cysteine
  13. residue that may be involved in a disulfide bond.
  14.  
  15. -Consensus pattern: L-S-V-[DE]-C-x-N-K-T
  16.                     [C may be involved in a disulfide bond]
  17. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  18. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  19. -Last update: December 1991 / First entry.
  20.  
  21. [ 1] Knaus P., Marqueze-Pouey B., Scherer H., Betz H.
  22.      Neuron 5:453-462(1990).
  23.